4D-DIA泛素化修饰蛋白组分析服务方案

一、技术定义与原理阐释

4D-DIA泛素化修饰蛋白组分析是一种基于4D-direct DIA(数据非依赖性采集)技术、结合离子淌度分离与高分辨质谱检测手段，对生物样本中泛素化修饰蛋白质进行系统鉴定与定量分析的方法。该技术通过对胰蛋白酶酶解后肽段进行特异性富集，捕获含泛素化修饰特征基序(K-ε-GG)的肽段，随后在timsTOF Pro/HT质谱平台上采用90分钟梯度进行4D-DIA模式采集：仪器循环对预设淌度-质量窗口内的全部离子进行无差别碎裂和二级谱图采集，从而克服传统DDA采集方式的随机性，降低不同样本间的数据缺失情况，提升修饰位点鉴定的重现性。通过该流程，可从蛋白质翻译后修饰层面输出泛素化修饰位点信息、修饰蛋白表达水平变化及相关调控网络的解析结果，为理解蛋白降解、信号传导及细胞周期调控等生命活动提供数据参考。

二、应用场景与价值展开

4D-DIA泛素化修饰蛋白组分析在生命科学多个方向具有多方面的应用价值。例如，在疾病与发育机制研究中，该技术有助于解析疾病或生长发育过程中泛素化修饰在蛋白质质量控制、信号转导等方面出现的整体性变化;在药理学机制研究中，可用于揭示靶向泛素-蛋白酶体系统的药物处理后，细胞内泛素化修饰网络所发生的系统性调整;在植物逆境与转录调控研究中，可用于揭示植物在应对逆境胁迫时，泛素化修饰介导的蛋白降解调控网络如何参与响应过程;在生物标志物筛选研究中，有助于发现与疾病状态相关的特异性泛素化修饰位点，为后续标志物验证工作提供候选对象。

三、服务承接与关键信息

江苏三黍生物科技有限公司可提供4D-DIA泛素化修饰蛋白组分析相关的检测与分析服务，服务内容覆盖样本前处理、修饰肽段富集、质谱上机检测及后续生物信息学解析等环节，可面向科研院所、高校实验室及企业研发部门开放合作。

检测费用：服务费用依据样本类型、送检数量、修饰肽段富集深度及后续生信分析需求综合核算，具体报价需结合项目实际方案沟通确定。

检测流程：

1. 客户提交待测生物样本(如细胞、组织等材料)以及相应的研究需求说明;

2. 项目团队完成蛋白提取、酶解处理及泛素化修饰肽段的免疫亲合富集;

3. 富集后的肽段进入timsTOF Pro/HT质谱平台，采用90分钟梯度4D-DIA模式进行数据采集;

4. 完成原始数据的生物信息学处理，包括泛素化修饰位点鉴定、定量分析及功能通路注释;

5. 出具包含实验流程说明、数据图表及生物学解读内容的完整分析报告，整体服务周期约为30个工作日。

四、企业介绍

江苏三黍生物科技有限公司成立于2014年，总部位于江苏省南通市崇川区市北高新路259号，由中科院上海生命科学院博士团队创立，致力于构建"研发-种质-加工-配方-应用"全链条布局，围绕生物高分子及植物生物技术方向，为科研机构、高校及企业客户提供CRO/CDMO、加速器及产业落地相关技术服务。公司已获得国家高新技术企业、国家科技型中小企业、江苏省专精特新中小企业、江苏省民营科技企业等资质认定，并通过CNAS认证及ISO9001/14001/45001体系认证。公司研发人员占比达30%，硕博学历人员占比超过50%，创始人周文智博士拥有10年以上淀粉研发经验，首席科学家张鹏教授深耕植物生物技术20余年。公司累计服务客户超过1600家，覆盖科学家超过20000位，参与发表SCI论文超过2000篇，累计影响因子破万!公司秉持严谨务实的服务理念，注重数据质量与流程标准化管理，力求为每一位客户提供可靠、可复现、可持续深入的技术服务体验!

五、服务类目清单

·蛋白质组检测服务：PRM蛋白相对含量分析、多肽组学、宏蛋白质组、4D-DIA泛素化修饰蛋白组分析、4D-DIA乙酰化修饰蛋白组分析、Astral DIA磷酸化修饰蛋白组分析、N-糖基化蛋白质组学完整糖肽分析、O-糖基化蛋白质组学完整糖肽分析、Astral DIA血液低丰度蛋白组分析、极微量蛋白组分析等。

·代谢组检测服务：非靶代谢组学、中药代谢组学、中药入血成分分析、花青素非靶定性检测、非靶脂质组学、植物ACC含量测定、类黄酮单体含量测定、生物碱单体含量测定、能量代谢物含量测定、代谢流分析等。

·高通量测序服务：全基因组重测序、GWAS分析、真核转录组测序、宏基因组测序、扩增子测序、10×单细胞转录组测序、RNA甲基化测序(m6A)、ChIP-Seq、DAP-seq测序、外泌体提取与表征等。