赛业生物基因治疗团队自研AI-AAV载体,开创眼底病微创基因治疗全新范式

图片来源:《Molecular Therapy Advances》
一、行业痛点:传统AAV眼底递送存在难以突破的临床瓶颈
视网膜退行性疾病(Retinal degenerations)是全球不可逆失明首要诱因,涵盖遗传性LCA、老年wAMD等上亿患者。腺相关病毒(AAV)是目前最成熟的体内基因治疗载体,但现有临床载体存在两大致命短板:
1. 给药方式创伤高:主流方案依赖视网膜下注射,针头穿刺分层视网膜,极易引发视网膜撕裂、黄斑病变、术后出血、新生血管加重等严重并发症;且注射仅能在局部“水泡区域”实现基因表达,无法覆盖广泛退化视网膜组织。
2. 玻璃体注射转染效率极低:传统AAV2、临床常用AAV2.7m8经玻璃体给药后,难以穿透视网膜多层屏障抵达感光细胞(外核层 ONL),黄斑区域转染比例极低,临床往往需要追加多次蛋白注射,治疗成本与患者依从性较差。传统AAV改造依靠定向进化、理性突变,筛选周期长达3年以上,文库通量受限,跨物种转染效果不稳定,长期依赖海外成熟衣壳专利,国内缺乏自主可控、经过非人灵长类验证的玻璃体专用AAV载体。
二、核心突破:赛业自研三模块 AI 迭代平台,一年完成新型衣壳开发
本研究核心创新为小鼠/非人灵长类双物种适配AI三重循环筛选体系,由赛业生物、译码基因独立搭建,整套流程实现全链路数字化预测+高通量NGS湿实验验证,相比传统定向进化开发周期缩短至1年,是全球少有的同时具备跨物种+多目标模型预测能力的AAV衣壳AI设计系统:

AI驱动AAV衣壳闭环筛选流程示意图
1. 双AI预测模型构建
产量预测模型:基于百万级AAV2衣壳插入突变NGS测序数据,融合CNN+LSTM深度学习框架,精准预测突变体包装能力,模型测试集斯皮尔曼相关系数R=0.852,大幅淘汰低产量突变株;
跨物种视网膜靶向模型:分别搭建小鼠、食蟹猴视网膜靶向预测模型,食蟹猴模型预测精度R=0.895,可提前预判变体在灵长类眼底转染能力,大幅降低非人灵长类实验成本。

双物种AI预测模型拟合效果图
2. 遗传算法闭环迭代筛选
以AAV2 VP3肝素结合区R587/588为突变插入位点,构建7–12氨基酸随机突变文库;通过NSGA-II多目标遗传算法持续生成新型序列,AI同步评估包装产量、小鼠视网膜靶向、灵长类视网膜靶向三大指标,自动循环迭代筛选高潜力变体,最终筛选得到最优变体AAV2.PN168。
3. 量产优势突出
AAV2.PN168病毒纯化后相对产量为野生型AAV2的2.74倍,工业化放大生产优势显著,适配临床级大规模制备需求。
三、多物种验证:AAV2.PN168玻璃体注射实现黄斑+全视网膜高效转染
研究严格遵循“小鼠→非人灵长类”递进式临床前验证逻辑,单细胞测序、组织荧光三维重建、ddPCR多重数据证实其碾压现有临床载体AAV2.7m8:
1. 非人灵长类(食蟹猴)核心数据
同等5×10¹⁰vg/眼玻璃体给药条件下:
视网膜全域荧光覆盖面积显著高于AAV2.7m8;
黄斑、中央、周边视网膜外核层(感光细胞层)GFP阳性细胞比例全面提升,黄斑区转染优势最突出;
眼底镜、单细胞免疫组化证实无明显眼部炎症、免疫细胞异常激活,安全性良好;
提升给药剂量可进一步扩大转染范围,无明显毒副作用。

食蟹猴视网膜各区域感光细胞转染效率定量对比

食蟹猴给药实验方案与眼底荧光成像结果
2. 小鼠体内广谱转染结果
活体荧光成像、视网膜切片定量、荧光素酶活体成像、ddPCR多重检测证明:单次玻璃体注射后,AAV2.PN168全视网膜表达强度显著优于AAV2.WT与AAV2.7m8,感光细胞、双极细胞、Müller胶质细胞多类眼底关键细胞实现高效基因递送。

小鼠变体筛选实验设计与荧光素酶表达定量

小鼠活体眼底镜与离体切片荧光强度对比
四、药效实锤:两大致盲眼病模型单次注射实现长效疾病改善
研究选取临床最经典的两类视网膜退行疾病模型,装载对应治疗基因验证临床转化价值,全部仅需单次玻璃体注射,区别于现有药物反复眼内给药方案:
1. LCA1(Gucy2d/e双敲除小鼠,先天性失明模型)
载体搭载感光细胞特异性hGRK启动子驱动人源GUCY2D修复基因:
注射28天、56天两次ERG电生理检测,暗视/明视视网膜电信号振幅大幅恢复,视觉功能显著优于AAV2.7m8给药组;
视动反应(OMR)行为学实验证实小鼠视觉感知能力明显回升;
ddPCR检测视网膜hGUCY2D mRNA表达量远高于对照组,实现感光细胞长效基因修复。

LCA1小鼠模型ERG电生理与视动反应药效检测图
2. wAMD(hVEGFA 转基因小鼠,新生血管渗漏模型)
载体编码雷珠单抗的抗VEGF片段:
单次AAV给药21天,眼底荧光血管造影显示视网膜下渗出快速消退,修复速度、恢复比例优于每周重复注射的雷珠单抗蛋白药物;
视网膜内抗VEGF抗体mRNA高表达,长效抑制异常新生血管,规避反复穿刺带来的感染、出血风险。

wAMD模型抗新生血管治疗效果示意图
五、研究局限与未来临床转化规划
论文客观阐述现阶段待优化方向,同时明确赛业生物后续技术迭代路线:
1. 现存优化空间
本研究主要使用广谱CAG启动子,后续将系统评估视网膜特异性启动子,降低表观沉默风险;
非人灵长类样本量有限,后续将扩大动物数量、延长6个月以上长期安全性观察;
衣壳与肝素受体作用机制待深入解析,为下一代AI变体优化提供结构基础。
2. 产业化与管线布局
知识产权完整自主:AAV2.PN168及整套AI筛选平台、给药方案已布局国内外发明专利,无海外专利依赖;
多适应症拓展:除LCA、wAMD外,后续将评估X连锁视网膜劈裂、其他遗传性视网膜变性等眼科适应症;
序列优化升级:采用密码子优化治疗基因,进一步降低临床给药剂量,提升安全窗口;
平台开放合作:赛业生物面向药企、科研机构开放AI-AAV定制筛选、眼底药效评价一站式CRO服务,加速国内眼科基因疗法研发进程。
六、行业价值:国产AI+AAV技术实现眼科基因递送跨越式突破
1. 给药范式革新:将高风险视网膜下手术替换为门诊微创玻璃体注射,大幅降低临床操作门槛与患者损伤,显著提升眼底基因治疗可及性;
2. AI生物融合标杆:证实AI深度学习可大幅缩短AAV衣壳研发周期,摆脱传统筛选低效瓶颈,为神经、肝脏等其他组织靶向AAV开发提供标准化国产技术范式;
3. 国产眼科基因递送自主突破:提升国内经过非人灵长类完整验证、适配玻璃体给药的自主AAV衣壳水平,打破海外载体技术垄断,支撑国内眼科基因治疗临床应用;
4. 公开AAV产量模型预测工具:业内首次公开AAV衣壳产量模型预测工具,为广大研发人员提供免费开放的AAV载体改造预测服务。
5. 全链条研发闭环示范:赛业生物实现 “AI衣壳设计-载体构建-AAV生产纯化-小鼠药效-非人灵长类药效评价” 全链条自主能力,为国内CGT企业提供一站式临床前研发解决方案。
七、团队介绍
本研究由赛业生物董事长韩蓝青(Lance Han)、译码基因负责人任盛(Sheng Ren)博士、广东省生物技术研究院张钰副院长共同作为通讯作者,崔漠尘、刘华清、蔡磊为共同一作,广州译码基因、赛业生物、广东省生物技术研究院、暨南大学医学院多单位协同完成。
结语
本次Molecular Therapy Advances论文发表,标志赛业生物AI驱动AAV衣壳工程技术完成国际同行权威验证。未来赛业生物将持续深化AI生物计算与基因递送载体研发融合,依托自主AAV平台、标准化疾病动物模型、临床前药效评价体系,携手全球生物医药合作伙伴推进多款眼底基因治疗候选药物开发,以国产创新载体技术,为数百万视网膜退行性失明患者带来更安全、长效、可及的全新治疗选择。
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